A explosão é uma ferramenta de alinhamento de sequência de DNA, disponível no NCBI. Identifica pares de segmentos semelhantes entre si. O maior par de pontuação é conhecido como o par de pontuação máxima. Este algoritmo consiste em três etapas. O primeiro passo envolve a busca por segmentos de alta pontuação. O segundo passo envolve identificar pares de baixa pontuação. A etapa final envolve a montagem das palavras que compõem a seqüência de interesse. Existem três etapas no processo de explosão.
A Blast é um programa que funciona comparando sequências e produz uma imagem computadorizada. A sequência de consulta aparece primeiro, seguida por linhas mais curtas que representam as seqüências de referência mais semelhantes à seqüência de consulta. As sequências de referência também são classificadas por similaridade percentual. Os hits são categorizados por espécies, genes e tipo de proteína. Em alguns cliques, os resultados de uma busca de explosão aparecerão em uma lista.
Depois de enviar um trabalho de explosão, os usuários podem alterar os parâmetros de formatação pressionando o botão Blast no formulário de aplicativos. Isso ocorre quando a pesquisa e o alinhamento foram concluídas. Depois que o trabalho terminar, a explosão apresentará um relatório de explosão. Na mesma página, eles podem introduzir novamente o trabalho atual e iniciar um novo com os mesmos parâmetros. Depois que um trabalho de explosão estiver concluído, os resultados aparecerão automaticamente no relatório de explosão. O usuário também pode definir os parâmetros de formatação na página de controle de formato.