BLAST è uno strumento per la ricerca di sequenze e identificare proteine simili. Il programma utilizza un'interfaccia basata sul Web. Per eseguire la ricerca, copiare la sequenza del genoma nel programma e quindi compilare le istruzioni. L'NCBI offre una vasta gamma di informazioni. È anche possibile eseguire il programma manualmente seguendo i passaggi delineati di seguito. Il processo è semplice e semplice. È possibile utilizzare BLAST per trovare e confrontare sequenze proteiche-proteine.
In BLAST, si inserisce la sequenza di query e la sequenza di destinazione. BLAST quindi cerca il database per sotto-sequence con una composizione di amminoacidi simili. Generalmente, il database è molto più grande della sequenza di query. Un database a una kilobase contiene milioni di nucleotidi. Questo fornirà una lista di partite che potrebbero essere una partita ravvicinata. Una lunga corrispondenza produrrà molti altri risultati di uno corto.
Il programma software BLAST è disponibile gratuitamente sul sito Web NCBI. Può anche essere acquistato se si desidera usarlo su una scala più ampia. Il programma è progettato per essere facile da usare ed è intuitivo. Per scaricare l'applicazione BLAST, visitare il sito Web NCBI. Una volta scaricato, l'applicazione inizierà il download. In alternativa, è possibile acquistare database BLAST sul negozio di riproduzione o sull'App Store. Una volta scaricato, il programma sarà disponibile nel menu Tutti gli App nell'applicazione Emulator.
Se non sei sicuro di come utilizzare BLAST, visitare il sito Web NCBIS. Il software fornisce istruzioni su come eseguire l'analisi. Usando il flag -m, è possibile modificare le impostazioni di sensibilità e velocità. Puoi anche cambiare le matrici del punteggio di amminoacidi per rendere i tuoi risultati più accurati. Queste opzioni ti consentiranno di selezionare il divario di punteggio più appropriato per la tua analisi. Questo processo può aiutare a determinare se i dati della sequenza sono accurati o meno.
