Fermeture de la base de données de séquences protéiques pour une séquence de requête. La séquence de requête est traduite dans les trois cadres de lecture sur les deux brins. Lorsque la correspondance est trouvée, Blast trouve la sous-séquence correspondante la plus proche. Ce processus est couramment utilisé dans la recherche en biologie moléculaire. Il existe plusieurs façons de faire exploser, mais tous ont besoin d'un utilisateur pour entrer la séquence de requête. Ce guide montre comment utiliser Blast.
Pour utiliser Blast, ouvrez d'abord une application d'émulateur. Ensuite, ouvrez le magasin de lecture ou de l'App Store. Cliquez sur Blast and Megablast et attendez qu'il soit téléchargé. Puis ouvrez l'application émulatrice. Dans le magasin de jeu, recherchez une explosion. Une fois l'application installée, accédez à la section All Apps et cliquez sur Blast & Megablast. Vous pouvez maintenant jouer à l'écran sur votre smartphone ou votre tablette.
Les recherches de souffle peuvent être visualisées à l'aide du logiciel SéquencesServer ou du style de circos. Les résultats montrent les séquences les plus longues correspondant à la séquence de la requête. Ces hits sont généralement plus longs que les séquences de base de données. Le programme d'explosion peut être utilisé à plusieurs fins, notamment la phylogénie, l'identification des espèces et la cartographie et la comparaison de l'ADN. Cette méthode est particulièrement utile pour trouver des paires de génomes homologues. Lorsqu'il est utilisé correctement, Blast peut également trouver des protéines dans le génome, telles que les ribosomes.
La sortie de souffle est divisée en trois parties. L'en-tête montre l'utilisateur le nom du programme d'explosion. Ensuite, il y a la séquence de référence et la séquence de requête. La deuxième partie de la sortie répertorie le nombre d'alignements importants trouvés, la valeur E et le pourcentage de la longueur de la requête. La troisième partie est un rapport supplémentaire qui affiche les résultats et fournit des informations complémentaires. Il n'y a pas d'autre moyen de faciliter le processus de recherche!
